Logo Politeknik Kesehatan Kemenkes Jayapura atau Poltekes Kemenkes Jayapura yang sebelumnya berada dibawah naungan Depkes, setelah Departemen berubah menjadi kementrian maka semua lembaga yang berada dibawahnya berubah pula namanya.
Khususnya untuk Politeknik Kesehatan Kemenkes yang berada dibawah naungan Kemenkes Jayapura, maka logo lembaga pun berubah mengikuti kementrian yang bersangkutan.